おじさんです！
先ほどポケモンGOの情報を調べていたら、知らなかった新事実が！
まあ普通に考えたら当たり前の事かも知れないんですが、「ポケモンGOで複数アカウントを所持する事は禁止だよ〜」って話です。
僕はポケモンGOのアカウントを1つしか持っていないのですが、「ポケモンGOプラス複数を使った効率的なポケモンの収集方法」なんて記事を妄想で書いていました。しかしアウトだとなると、この方法は出来なそうです。
ちょっと残念ですが、規約には従いましょう（自己責任）。
ポケモンGOで複数アカウントを作成することは禁止？
ポケモンGOで複数アカウントを作成する事は明確に禁止されています。
規約には以下の様にあります。
不正行為（チート）
（中略）
複数アカウントでプレイすること。（1プレイヤー 1アカウントでお願いします。）
複数のアカウントの利用は「不正行為」として書かれています。
ポケモンGOで複数アカウントを持つとBAN（アカウント停止・凍結）される？
複数アカウントの利用は「不正行為」とされていますが、複数アカウントの所持、利用をした事でアカウント停止などの処分を受けた人はまだいない（少ない？）様です。
これは恐らく「ポケモンGOのアカウントを何十個単位で作って育成して、販売する業者」を対象にしている様な気がしないでもないので、「2個持ってます」くらいのユーザーは対象にならないかも知れません。
それに複数のアカウントを「このアカウントとこのアカウントは同一人物のもの・・・」と運営が判断することは難しいはずです。
とは言え明確に禁止された行為なので、今後は複数アカウントの作成はせず、すでに複数アカウントの作成をしてしまった人も「メインのアカウントを決めてそれだけにログインする」という様にした方が良さそうです。
アカウント凍結されたら2個目のアカウントを作れないの？
不正行為をするとアカウントBAN（凍結・停止）の処分を貰う事があります。
その場合、同じアカウントを再度利用する事は出来ないので、新しいアカウントを作るしかありません。
これは「複数アカウントの作成」に当たるのか？と言えば厳密にはそうなのでしょうが、恐らくその事によってペナルティを受ける事はないかと思います。
「今現在プレイに使っているアカウントは1つ」という状態であれば大丈夫そうです。